Mantener con éxito sistemas naturales en un país megadiverso como México requiere el pleno reconocimiento de los derechos, conocimientos y prácticas de los Pueblos Indígenas. Es fundamental que las comunidades locales mejoren sus economías y medios de vida, al tiempo que salvaguardan sus derechos y continúan gobernando sus recursos de manera que las beneficien tanto a ellas como a la naturaleza.

El enfoque de trabajo de WWF en materia de agua integra a las comunidades en la recopilación de datos, mejora de las prácticas agrícolas e implementación de agroecología, establecimiento de viveros y restauración, gestión participativa del agua, sensibilización y reducción de la contaminación del agua.

WWF colabora con autoridades públicas, organizaciones comunitarias locales, iniciativa privada, organismos de investigación y otras ONG. El Programa Agua de WWF se ha fortalecido principalmente con el apoyo de la Fundación Gonzalo Río Arronte. Otros socios del programa son: Caudalie, USAID, BID, Fundación Coca- Cola, Arca Continental, HSBC, Fundación AXA, Mezcal Amarás, IKEA Social Entrepeneurship, Bezos Earth Fund, Airbnb, Starbucks, P&G, Grupo Modelo, la Agencia Francesa de Desarrollo y Conservation International.